Es originario de la Ciudad de México. Obtuvo el título de Licenciado en Derecho en la Universidad Iberoamericana y obtuvo los grados de Maestría y Doctorado en Derecho, con mención honorífica, en la Universidad Nacional Autónoma de México.

Obtuvo la patente de aspirante al ejercicio del notariado en la Ciudad de México y resultó triunfador en el examen de oposición el día 18 de febrero de 1994 para obtener la patente de Notario No. 203 de la Ciudad de México.

Profesor de la materia Contratos Civiles en la Universidad Panamericana (UP).

Profesor de las materias Teoría General de las Obligaciones y Contratos Civiles en la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM).

Profesor de la materia Teoría del Acto Jurídico, en la División de Estudios de Posgrado de la Facultad de Derecho de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM).

Integrante del Claustro de Doctores de la Facultad de Derecho de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM).

Conferencista Permanente del Colegio Nacional del Notariado Mexicano y del Colegio de Notarios de la Ciudad de México.

A lo largo de su trayectoria profesional, el Dr. Juan José Pastrana Ancona ha sido autor de diversas publicaciones relacionadas con la actividad notarial.